Ce sanctuaire est original car il est dédié à 2 triades divines différentes d’où une organisation bipartite de l’architecture. La partie gauche est dédiée au dieu faucon Haroéris et la partie droite au dieu crocodile Sobek. Au fond du temple il y a 2 naos.
L'édifice remonte à l’époque gréco-romaine, le plus ancien roi figuré sur les reliefs étant Ptolémée VI (3ème s. ap. J.-C.). mais, dans les ruines du -mammisi on a retrouvé des blocs portant le cartouche de Thoutmosis, donc le temple existait déjà sous la XVIIIe dynastie.
Ce qui est remarquable dans ce temple c’est la finesse des reliefs gravés sur les parois des salles et,  sur les colonnes de la première cour on retrouve encore les couleurs d'origine. 
Sur le mur d'enceinte qui entoure le temple, un tableau présente des instruments médicaux et chirurgicaux disposés sur plusieurs registres. Une légende entoure Haroéris. Ses yeux sont le soleil et la lune. Lorsque les deux astres sont invisibles, il est aveugle. Ce handicap ne l'empêche pourtant pas de combattre, mais l'issue des batailles est souvent désastreuse : non seulement il extermine les conspirateurs, mais il lui arrive, par mégarde, de tuer les autres divinités, même celles qui soutiennent le monde. Pour conjurer la maladie d'Haroéris, les prêtres de Kom-Ombo ont décidé de faire graver, sur les parois de son temple, les instruments pour soigner symboliquement le dieu : pinces, ciseaux, tenailles, scalpels..
Le temple de Kom Ombo
Le temple vu du bateau
En dehors du temple, sous le sable, des vestiges attendent d’être découverts.
Sanctuaire d’Hathor contenant des crocodiles momifiés.
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Le roi faisant des offrandes à Hathor et Sobek
Le roi face à Haroéris
Cartouche de Ptolémée
Double entrée du temple
Aspect typique d’un temple égyptien
Les offrandes du pharaon au dieu Sobek
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Haroéris
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Sobek
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Sobek
Les instruments chirurgicaux
l’accouchement
Finesse de l’écriture
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La finesse et la transparence des tissus
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Les ennemis captifs
Cartouche d’un roi étranger